More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2760 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2760  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0281  flagellar biosynthesis protein FliP  54.81 
 
 
254 aa  253  3e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  44.96 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0186  flagellar biosynthetic protein FliP  45.06 
 
 
262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.14334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  48.21 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
250 aa  211  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  44.8 
 
 
255 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  43.75 
 
 
247 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  43.93 
 
 
251 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  47.62 
 
 
252 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  43.3 
 
 
256 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  43.4 
 
 
281 aa  208  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  44.49 
 
 
244 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  46.22 
 
 
260 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  43.61 
 
 
244 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  45.98 
 
 
245 aa  206  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  43.61 
 
 
244 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
221 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  44.05 
 
 
244 aa  203  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  45.81 
 
 
248 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  48.57 
 
 
222 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  43.72 
 
 
252 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  52.88 
 
 
255 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
213 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
278 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  51.83 
 
 
253 aa  201  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  43.5 
 
 
254 aa  201  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  45.58 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  45.27 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  40.22 
 
 
281 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  46.57 
 
 
248 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
276 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
276 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  44.19 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  45.79 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  43.42 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  48.1 
 
 
222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  42.54 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
256 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  44.24 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  44.93 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  39.92 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 
276 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 
234 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  46.34 
 
 
254 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  46.83 
 
 
254 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.3 
 
 
253 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  42.39 
 
 
266 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.3 
 
 
253 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.3 
 
 
253 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.3 
 
 
253 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 
253 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 
253 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
317 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  45.37 
 
 
254 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  44.24 
 
 
261 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  42.47 
 
 
255 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  42.61 
 
 
251 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  42.61 
 
 
251 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  43.23 
 
 
277 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  44.39 
 
 
246 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  44.88 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  43.53 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  44.39 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  40.61 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  42.92 
 
 
258 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  42.73 
 
 
238 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  42.79 
 
 
279 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  44.29 
 
 
274 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  44.29 
 
 
274 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
261 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  42.73 
 
 
262 aa  188  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  43.78 
 
 
243 aa  188  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  42.49 
 
 
254 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0929  flagellar biosynthesis protein FliP  43.56 
 
 
251 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  38.75 
 
 
247 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 
248 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 
248 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 
248 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  44.05 
 
 
251 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 
248 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  41.32 
 
 
289 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  43.84 
 
 
274 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
255 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  44.39 
 
 
255 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  41.74 
 
 
248 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  45.09 
 
 
223 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
248 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
248 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
248 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
248 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  44.19 
 
 
245 aa  185  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  45.28 
 
 
245 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>