More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2761 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2761  type I secretion target repeat-containing protein  100 
 
 		 309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0511056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.51 
 
 		 2105 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.45 
 
 		 1795 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.86 
 
 		 3427 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 946 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.06 
 
 		 1279 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 		 1016 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  48.17 
 
 		 4334 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.79 
 
 		 2954 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.61 
 
 		 1164 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.64 
 
 		 1424 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  43.59 
 
 		 595 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.6 
 
 		 1287 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  40.88 
 
 		 4798 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  44.57 
 
 		 3619 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  44 
 
 		 3619 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.2 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.53 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.2 
 
 		 2667 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 1236 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.62 
 
 		 1363 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 1534 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.19 
 
 		 588 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  44.59 
 
 		 2885 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  43.52 
 
 		 1532 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  42.94 
 
 		 232 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.15 
 
 		 757 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  45.71 
 
 		 982 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  48.57 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.1 
 
 		 421 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.77 
 
 		 709 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  43.82 
 
 		 813 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  49.36 
 
 		 686 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.05 
 
 		 980 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  40.41 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 795 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.96 
 
 		 3954 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 		 1895 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 		 424 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.77 
 
 		 1400 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.79 
 
 		 1883 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  39.6 
 
 		 375 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  41.95 
 
 		 243 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 615 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  47.86 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.18 
 
 		 686 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  44.25 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.57 
 
 		 613 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  42.93 
 
 		 491 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.14 
 
 		 219 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 		 5171 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.12 
 
 		 572 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  43.18 
 
 		 950 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.18 
 
 		 2145 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  43.18 
 
 		 1814 aa  92.4  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  40.28 
 
 		 2689 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  43.65 
 
 		 437 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  47.45 
 
 		 742 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  43.65 
 
 		 437 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.22 
 
 		 833 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  43.84 
 
 		 3608 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 589 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  44.83 
 
 		 850 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  43.51 
 
 		 729 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.68 
 
 		 1963 aa  89.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  41.41 
 
 		 202 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.41 
 
 		 202 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.09 
 
 		 526 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  39.59 
 
 		 606 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 206 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  39.6 
 
 		 639 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  40.2 
 
 		 824 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.8 
 
 		 1019 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  42.94 
 
 		 734 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  45.11 
 
 		 236 aa  85.9  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  46.88 
 
 		 1156 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  40.11 
 
 		 744 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  37.7 
 
 		 769 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  41.81 
 
 		 959 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  37.85 
 
 		 736 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  42.37 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  48.06 
 
 		 1499 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 4800 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  41.57 
 
 		 860 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 1175 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.77 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  35.24 
 
 		 680 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.57 
 
 		 2678 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.98 
 
 		 1055 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  42.94 
 
 		 741 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.66 
 
 		 1855 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>