More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89338 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_89338  arnesyl diphosphate synthetase (FPP synthetase)  100 
 
 		 350 aa  715    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04510  isoprenoid biosynthesis-related protein, putative  61.36 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08012  polyprenyl synthetase (Eurofung)  58.57 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.149955  normal  0.151034 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49325  predicted protein  51.2 
 
 		 343 aa  348  8e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34113  predicted protein  46.42 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.48 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  33.98 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  31 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  26.33 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  28.33 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  28.51 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  27.19 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  25.73 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.57 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.25 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  25.78 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.46 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  28.35 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  29.39 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  24.33 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  25.81 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  31.58 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  28.79 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  26.25 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  26.14 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 634 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.86 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  28.89 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  27.71 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  28.03 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  27.31 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.17 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  28.4 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  28.4 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  27.8 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  28.4 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  26.25 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  28.44 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.61 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  25.66 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  25.5 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  27.76 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.17 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  25.46 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.43 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1503  Dimethylallyltranstransferase  25.71 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.11 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  25.99 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  24.45 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  23.51 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  28.65 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  24.21 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  25.35 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  31 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  25.62 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  24.72 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  26.57 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  26.89 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  24.91 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  24.78 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  26.28 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  26.59 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  28.33 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  26.27 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.44 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  26.79 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  23.77 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  24.45 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  24.51 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  25.43 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  26.67 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  30.67 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0342  Polyprenyl synthetase  27.96 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.249196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  28.85 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  28.31 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  28.5 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  23 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  25.47 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  26.57 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  26.89 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  26.54 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  26.2 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  25.7 
 
 		 1155 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0620  Polyprenyl synthetase  30.39 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  25.35 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.48 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  24.65 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  26.53 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  25.76 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  26.69 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  25.89 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  26.18 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  25.89 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  25.76 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  25.89 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>