More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0620 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0620  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  44.79 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  40.56 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  42.58 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.76 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  41.22 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.37 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  41.2 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  42.45 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.15 
 
 		 295 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  39.45 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  37.98 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  37.22 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.53 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  36.04 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  35.88 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  36.39 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  39.66 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  39.31 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  40.76 
 
 		 297 aa  175  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  39.22 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  41.15 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  35.59 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  39.22 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  36.81 
 
 		 337 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  34.06 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  42.75 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  35.43 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.73 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  34.81 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  40.66 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  39.23 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  35.82 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  42.58 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  38.41 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  38.71 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  37.36 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  36.01 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  38.98 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  44.3 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  38.13 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  42.04 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  38.31 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  32.42 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  42.04 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  42.04 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  42.04 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  42.04 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  42.04 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  36.08 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  35.8 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  37.59 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  42.04 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  41.95 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  42.04 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  37.69 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  33.79 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  37.35 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  38.76 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  39.06 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  37.59 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  35.94 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  34.51 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  42.17 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  42.17 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  42.17 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  42.17 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  42.17 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  39.93 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  35.41 
 
 		 299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  35.05 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  36.36 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  35.07 
 
 		 306 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  40.65 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  35.32 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>