More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34113 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34113  predicted protein  100 
 
 		 348 aa  710    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04510  isoprenoid biosynthesis-related protein, putative  51.14 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08012  polyprenyl synthetase (Eurofung)  51.59 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.149955  normal  0.151034 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49325  predicted protein  50.94 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89338  arnesyl diphosphate synthetase (FPP synthetase)  46.42 
 
 		 350 aa  325  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.33 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  30.26 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.92 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.37 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.33 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  28.63 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.74 
 
 		 325 aa  86.3  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  27.18 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  26.49 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  28.36 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.71 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  27.6 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  26.91 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  28.46 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  28.94 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  25.22 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  30.48 
 
 		 634 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  30.09 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  28.64 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.87 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  27.06 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  27.2 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  28.74 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  28.76 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  28.78 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  26.32 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  27.65 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  26.87 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.7 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  25.11 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  24.55 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  27.08 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  26.94 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.3 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  29.59 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  27.46 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  25.75 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  27.73 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  29.59 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  29.59 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  25.45 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  27.82 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  28.21 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  29.18 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1503  Dimethylallyltranstransferase  27.08 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  27 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  27.38 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.76 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  26.11 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.64 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  30.62 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  26.79 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  30.3 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  28.07 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  29.18 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  27.36 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  27.74 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.11 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  26.09 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  24.88 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  24.41 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  24.67 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  24.5 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  28.5 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  25.59 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  27.48 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  26.16 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  23.88 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  26.16 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  26.16 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  26.77 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  26.36 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  28.57 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  25.99 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  25.94 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  26.47 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  27.83 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  28.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  28.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  28.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  28.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  27.06 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  25 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  28.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  25 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  28.19 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>