188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0433 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  46.44 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  43.97 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.86 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  40.38 
 
 		 257 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  44.02 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  40 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  38.49 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.41 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  37.6 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.1 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  41.99 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.98 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  31.6 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  31.07 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  26.58 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  23.24 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  26.77 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  25.97 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  25.21 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  25.96 
 
 		 764 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  24.89 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  38.38 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  24.89 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  25.54 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  23.86 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  22.71 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  25.58 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  24.56 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  26.27 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  24.77 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  24.77 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  35.78 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  25.1 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  23.87 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01680  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  28.64 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  24.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  22.36 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  25.43 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  24.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  23.99 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  21.95 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  23.25 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  27.7 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  24.6 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  28.28 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  28.28 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  33.62 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  24.26 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  24.24 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  25.75 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  28.08 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  29.38 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  24.68 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  26.97 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  23.05 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  26.71 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.604271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  22.66 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  30.41 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  23.04 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  22.66 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  31.08 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.48 
 
 		 732 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0508  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33 
 
 		 702 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.412666  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  23.38 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0934  3' exoribonuclease  37.93 
 
 		 741 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00161965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.3 
 
 		 718 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  24.48 
 
 		 501 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1269  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.3 
 
 		 719 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124632  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1689  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.32 
 
 		 728 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1390  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.67 
 
 		 719 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.66 
 
 		 772 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  25.76 
 
 		 711 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  25.73 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0666  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.32 
 
 		 728 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  25.91 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  28.28 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  31.08 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  28.28 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0237  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.69 
 
 		 711 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.348858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  24.31 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3029  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.51 
 
 		 721 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  25.75 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  24.26 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 755 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  23.17 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  22.32 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.67 
 
 		 735 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>