More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1791 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  72 
 
 		 280 aa  407  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  44.8 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.86 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  41.95 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.05 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.49 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.92 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.49 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  40.62 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.49 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.11 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.55 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  25.09 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  37.23 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  32.08 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  22.98 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  27.78 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  29.33 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  28.57 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  27.84 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  26.85 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  26.01 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  28 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0778  ribonuclease PH  27.27 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225332  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  27.03 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  27.12 
 
 		 764 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  25.2 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  26.86 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  28.19 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  27.35 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  26.49 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  26.34 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  24.02 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  26.87 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  27.56 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  26.79 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  26.43 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  26.95 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  25.11 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  27.8 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  28.15 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  25.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  26.11 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  26.07 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  27.15 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  30.09 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  25.68 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  26.43 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  26.43 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  26.56 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0413  ribonuclease PH  27.83 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  26.43 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  26.43 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  25.21 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  26.07 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  25.45 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  27.89 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  26.11 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  26.92 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  35.42 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  27.19 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  25.7 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  25.88 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  24.8 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  27.19 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  22.96 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  27.19 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  26.01 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  24.02 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  28.12 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  25 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  26.34 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  26.34 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  24.02 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  25.39 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  25 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>