More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0567 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  100 
 
 		 250 aa  500  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 245 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  60.17 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  59.41 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  58.92 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  54.17 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  58.92 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  56.07 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  56.72 
 
 		 238 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  56.54 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  60.42 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  57.79 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  57.74 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  57.79 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  57.32 
 
 		 244 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  55.23 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  57.74 
 
 		 251 aa  261  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  60.25 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  57.98 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  58.33 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  57.68 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  56.38 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  58.02 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  58.33 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  52.4 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  59.41 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  57.26 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  57.32 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  54.55 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  57.74 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  57.74 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  54.96 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  59.83 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  53.14 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 257 aa  254  7e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  57.38 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  52.84 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  52.94 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  54.47 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  58.04 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  54.73 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  55.14 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 260 aa  252  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  55.14 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  55.19 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  55.14 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 238 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 245 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  55.19 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  251  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  56.25 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 235 aa  251  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 235 aa  251  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  55.97 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  53.11 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  59.34 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>