More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2240 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  97.58 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 261 aa  314  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  62.34 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 263 aa  308  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  59.18 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  57.61 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  60.41 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  59.84 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  58.02 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 245 aa  294  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  54.03 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 243 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 258 aa  287  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  58.3 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  58.47 
 
 		 241 aa  284  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 238 aa  284  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  58.01 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 237 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 237 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 237 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 237 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 238 aa  279  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  63.98 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>