More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2474 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  73.64 
 
 		 239 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  73.31 
 
 		 238 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  67.93 
 
 		 238 aa  345  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  67.65 
 
 		 239 aa  343  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  69.49 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 239 aa  331  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  65.4 
 
 		 239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 239 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 238 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  65.13 
 
 		 238 aa  322  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 241 aa  321  8e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 241 aa  321  8e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  63.33 
 
 		 246 aa  318  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 239 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  62.34 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  61.92 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 239 aa  311  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 237 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 238 aa  310  9e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  63.2 
 
 		 246 aa  310  9e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  308  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 238 aa  307  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 239 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 237 aa  305  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  61.21 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  61.21 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 237 aa  304  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 238 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 246 aa  301  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 240 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 238 aa  301  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>