More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2159 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  92.44 
 
 		 238 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  91.18 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  81.51 
 
 		 238 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  79.41 
 
 		 239 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  75.74 
 
 		 246 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  75.11 
 
 		 241 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  73.62 
 
 		 241 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  74.68 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  73.19 
 
 		 246 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  74.15 
 
 		 246 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  74.15 
 
 		 246 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  74.15 
 
 		 246 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  72.34 
 
 		 246 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  74.15 
 
 		 243 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  358  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  73.62 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  72.34 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  72.03 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  71.49 
 
 		 246 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  71.43 
 
 		 238 aa  353  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  70.64 
 
 		 244 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  70.64 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  72.77 
 
 		 253 aa  347  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  71.19 
 
 		 244 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  69.2 
 
 		 238 aa  341  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  70.21 
 
 		 241 aa  338  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  68.35 
 
 		 238 aa  332  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  68.94 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  65.82 
 
 		 238 aa  329  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  67.37 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  68.22 
 
 		 238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  65.11 
 
 		 239 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  64.68 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 238 aa  321  8e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 238 aa  321  8e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 241 aa  318  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 241 aa  318  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  64.68 
 
 		 239 aa  317  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  317  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 237 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  70.34 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 237 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  309  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 239 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  305  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  63.68 
 
 		 242 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  63.68 
 
 		 242 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 240 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 240 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 240 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>