More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0043 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  74.68 
 
 
246 aa  363  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  74.47 
 
 
246 aa  360  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  73.62 
 
 
246 aa  358  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  73.62 
 
 
246 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  73.31 
 
 
243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  72.88 
 
 
246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  72.88 
 
 
246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  72.88 
 
 
246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  73.19 
 
 
241 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  72.46 
 
 
246 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  72.46 
 
 
246 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  71.43 
 
 
238 aa  353  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  72.88 
 
 
243 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  72.88 
 
 
243 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  72.88 
 
 
243 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  72.88 
 
 
243 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  72.88 
 
 
243 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  72.88 
 
 
243 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  72.46 
 
 
243 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  73.19 
 
 
243 aa  351  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  72.27 
 
 
238 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  69.49 
 
 
238 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  71.43 
 
 
238 aa  347  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  70.17 
 
 
238 aa  345  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  68.49 
 
 
239 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  69.92 
 
 
244 aa  342  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  68.64 
 
 
238 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  69.36 
 
 
246 aa  338  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  67.51 
 
 
241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  69.07 
 
 
238 aa  335  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  69.36 
 
 
244 aa  334  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  68.09 
 
 
239 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  68.94 
 
 
244 aa  333  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  67.8 
 
 
238 aa  332  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  67.66 
 
 
239 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  69.36 
 
 
243 aa  331  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  69.07 
 
 
243 aa  331  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  68.94 
 
 
241 aa  329  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  65.68 
 
 
239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  68.64 
 
 
243 aa  327  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  68.94 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  65.96 
 
 
239 aa  325  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  66.95 
 
 
243 aa  325  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  65.82 
 
 
239 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  64.56 
 
 
239 aa  321  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  64.98 
 
 
239 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  65.68 
 
 
238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  65.68 
 
 
237 aa  318  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  65.11 
 
 
239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  65.25 
 
 
240 aa  318  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  66.81 
 
 
253 aa  318  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  64.41 
 
 
239 aa  318  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  65.25 
 
 
240 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  63.98 
 
 
237 aa  317  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  65.68 
 
 
239 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  66.1 
 
 
243 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  64.56 
 
 
239 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  65.25 
 
 
240 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  65.25 
 
 
238 aa  315  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  64.41 
 
 
237 aa  315  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  66.81 
 
 
239 aa  314  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  67.8 
 
 
243 aa  313  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  66.24 
 
 
238 aa  313  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  63.98 
 
 
237 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  64.41 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  64.83 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  64.41 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  64.41 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  64.41 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  311  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  64.41 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  64.71 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  64.83 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  64.41 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  64.98 
 
 
238 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  64.98 
 
 
238 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  63.71 
 
 
238 aa  311  6.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  65.25 
 
 
237 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  64.98 
 
 
238 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  64.56 
 
 
238 aa  309  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  64.83 
 
 
238 aa  308  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  308  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  64.14 
 
 
238 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  64.83 
 
 
237 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  62.71 
 
 
242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  64.14 
 
 
238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  65.53 
 
 
241 aa  305  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  65.53 
 
 
241 aa  305  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  63.4 
 
 
235 aa  304  7e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  63.4 
 
 
235 aa  304  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  64.1 
 
 
242 aa  304  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  64.1 
 
 
242 aa  304  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  63.56 
 
 
238 aa  304  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>