More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3580 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  74.79 
 
 		 239 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  76.89 
 
 		 238 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  73.11 
 
 		 239 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  74.37 
 
 		 238 aa  370  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  73.95 
 
 		 238 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  71.85 
 
 		 239 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  73.11 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  73 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  72.15 
 
 		 239 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  73.42 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  72.57 
 
 		 237 aa  362  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0401  ribonuclease PH  72.57 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  72.15 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 237 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0434  ribonuclease PH  72.57 
 
 		 237 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  72.57 
 
 		 237 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  72.03 
 
 		 237 aa  360  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  72.38 
 
 		 239 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  71.61 
 
 		 237 aa  359  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  70.46 
 
 		 237 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2943  ribonuclease PH  68.78 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3641  ribonuclease PH  66.39 
 
 		 240 aa  333  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0778  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 237 aa  329  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225332  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 237 aa  328  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  67.65 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  66.11 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 241 aa  314  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  65.4 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  65.4 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 239 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3006  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 246 aa  298  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 246 aa  296  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0167  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 246 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 238 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0567  ribonuclease PH  65.57 
 
 		 238 aa  291  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 239 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1664  ribonuclease PH  63 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 241 aa  286  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  62.5 
 
 		 244 aa  286  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  68.1 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  60.85 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  60.26 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>