More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2477 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  93.28 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  79.41 
 
 		 238 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  80.67 
 
 		 238 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  79.83 
 
 		 238 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  75.11 
 
 		 241 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  76.6 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 246 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  72.77 
 
 		 246 aa  362  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  73.73 
 
 		 243 aa  361  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  73.42 
 
 		 246 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  74.89 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  73.31 
 
 		 243 aa  358  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  73.31 
 
 		 243 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  73.62 
 
 		 244 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  73.31 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  73.19 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  71.49 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  71.49 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  72.77 
 
 		 244 aa  354  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  70.64 
 
 		 246 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  72.03 
 
 		 244 aa  349  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  73.19 
 
 		 253 aa  348  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  68.49 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  69.49 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  66.67 
 
 		 238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  66.53 
 
 		 238 aa  320  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  66.81 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  67.23 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 243 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  307  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  65.53 
 
 		 241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  65.53 
 
 		 241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 239 aa  304  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  68.64 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  63.03 
 
 		 245 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 239 aa  298  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 239 aa  294  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3641  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 239 aa  294  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  55.7 
 
 		 239 aa  290  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  56.17 
 
 		 261 aa  288  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.97 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>