More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2403 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  100 
 
 
246 aa  496  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  95.53 
 
 
246 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  95.1 
 
 
246 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  95.1 
 
 
246 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  95.12 
 
 
246 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  95.1 
 
 
246 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  92.98 
 
 
243 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  87.55 
 
 
243 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  87.55 
 
 
243 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  87.55 
 
 
243 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  87.55 
 
 
243 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  87.97 
 
 
243 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  87.55 
 
 
243 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  87.14 
 
 
243 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  87.55 
 
 
243 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  83.4 
 
 
246 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  82.57 
 
 
246 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  81.74 
 
 
246 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  74.68 
 
 
238 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  71.97 
 
 
246 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  74.68 
 
 
238 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  74.68 
 
 
238 aa  363  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  75.11 
 
 
238 aa  362  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  73.42 
 
 
239 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  73.84 
 
 
238 aa  358  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  73.22 
 
 
243 aa  358  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  73.64 
 
 
243 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  72.92 
 
 
241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  74.14 
 
 
243 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  70.76 
 
 
238 aa  351  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  72.57 
 
 
241 aa  349  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  71.06 
 
 
238 aa  347  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  69.58 
 
 
244 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  70.9 
 
 
253 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  69.17 
 
 
244 aa  345  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  69.29 
 
 
243 aa  340  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  69.79 
 
 
238 aa  339  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  68.91 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  68.18 
 
 
244 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  68.91 
 
 
241 aa  331  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  67.09 
 
 
239 aa  329  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  66.67 
 
 
239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  66.24 
 
 
239 aa  327  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  65.53 
 
 
239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  66.38 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  65.55 
 
 
241 aa  319  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  64.68 
 
 
239 aa  318  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  65.55 
 
 
241 aa  319  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  65.55 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  65.96 
 
 
238 aa  318  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  72.41 
 
 
243 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  65.13 
 
 
240 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  64.26 
 
 
238 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  64.29 
 
 
240 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  65.11 
 
 
239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  63.87 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  63.87 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  62.55 
 
 
242 aa  310  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  63.87 
 
 
240 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  63.87 
 
 
240 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  63.98 
 
 
238 aa  309  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  61.8 
 
 
235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  61.8 
 
 
235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  65.09 
 
 
238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  65.09 
 
 
237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  63.71 
 
 
239 aa  308  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  62.71 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  62.71 
 
 
239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  61.02 
 
 
238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  66.52 
 
 
242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  66.52 
 
 
242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  61.02 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  62.87 
 
 
239 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  63.4 
 
 
238 aa  305  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  64.68 
 
 
238 aa  304  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  64.14 
 
 
239 aa  304  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.98 
 
 
239 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  62.98 
 
 
239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  62.34 
 
 
246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  62.82 
 
 
239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  62.13 
 
 
237 aa  301  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  66.38 
 
 
238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  62.55 
 
 
237 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  63.4 
 
 
237 aa  301  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  62.61 
 
 
245 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  65.11 
 
 
238 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  62.87 
 
 
239 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  63.95 
 
 
238 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  62.55 
 
 
237 aa  299  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  65.11 
 
 
238 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  61.44 
 
 
237 aa  299  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  64.26 
 
 
238 aa  299  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  62.13 
 
 
238 aa  298  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  63.52 
 
 
238 aa  298  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>