More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1971 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  83.87 
 
 		 260 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  83.47 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  79.84 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  80.82 
 
 		 254 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  82.26 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3844  ribonuclease PH  83.06 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3830  ribonuclease PH  83.06 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3918  ribonuclease PH  83.06 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  80.83 
 
 		 246 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  77.14 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  68.2 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  70.46 
 
 		 242 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  67.5 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  68 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  70.29 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  66.81 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  69.46 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  66.81 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  62.7 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  69.16 
 
 		 257 aa  295  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  63.45 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  67.23 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 239 aa  288  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  65.4 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  69.07 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  68.86 
 
 		 279 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  64.56 
 
 		 238 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  65.78 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  60.33 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  56.07 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  64.66 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  60.78 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  59.65 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  60.25 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  61.63 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  58.26 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 239 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  60.26 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  60.26 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  55.79 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  55.79 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 244 aa  269  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  59.24 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  57.98 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  58.09 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  58.09 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  58.09 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  57.98 
 
 		 239 aa  268  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  58.09 
 
 		 246 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  55.22 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  57.32 
 
 		 243 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 243 aa  262  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>