More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1294 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  81.92 
 
 		 260 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  83.87 
 
 		 251 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  79.54 
 
 		 259 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  80.69 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  79.53 
 
 		 254 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3830  ribonuclease PH  80.69 
 
 		 260 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3844  ribonuclease PH  80.69 
 
 		 260 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3918  ribonuclease PH  80.69 
 
 		 260 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  75.98 
 
 		 258 aa  367  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  80.33 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  65.27 
 
 		 254 aa  299  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  66.67 
 
 		 242 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  65.27 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 252 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  67.84 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  66.22 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  61.73 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  61.32 
 
 		 253 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  67.45 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  67.8 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  66.53 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  66.53 
 
 		 241 aa  279  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  275  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  61 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  60.92 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 239 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  63.71 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  61.02 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  63.56 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  61.45 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  56.07 
 
 		 261 aa  268  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  60.09 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  60.42 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  60.42 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  60.42 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  60.42 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  56.25 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 239 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>