More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2358 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  96.15 
 
 		 260 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  84.23 
 
 		 259 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3830  ribonuclease PH  90.77 
 
 		 260 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3844  ribonuclease PH  90.77 
 
 		 260 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3918  ribonuclease PH  90.77 
 
 		 260 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  80.69 
 
 		 260 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  82.26 
 
 		 251 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  77.78 
 
 		 254 aa  401  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  76.28 
 
 		 258 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  79.08 
 
 		 246 aa  362  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  68.64 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  70.71 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  70.71 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  66.24 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  66.37 
 
 		 248 aa  301  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 239 aa  297  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  64.14 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  69.2 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  68.44 
 
 		 257 aa  292  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 252 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 252 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  61.48 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  65.04 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  66.38 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  60.58 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  67.14 
 
 		 279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  281  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  63.14 
 
 		 238 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  278  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  57.45 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  57.45 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 239 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 237 aa  275  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 239 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  59.58 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  58.97 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  57.26 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 237 aa  272  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  59.41 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  57.81 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  57.5 
 
 		 246 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  57.92 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>