More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1701 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  80.83 
 
 		 251 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  79.5 
 
 		 260 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  80.33 
 
 		 260 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  79.25 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  78.33 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  79.08 
 
 		 260 aa  362  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  75.52 
 
 		 258 aa  351  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3830  ribonuclease PH  78.24 
 
 		 260 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3918  ribonuclease PH  78.24 
 
 		 260 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3844  ribonuclease PH  78.24 
 
 		 260 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  69.14 
 
 		 262 aa  315  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  70.46 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  69.78 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  66.11 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  64.02 
 
 		 239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  66.39 
 
 		 254 aa  304  7e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  63.18 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  68.2 
 
 		 238 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  69.71 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  70.12 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  70.35 
 
 		 257 aa  299  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  65.13 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  65.27 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  71.19 
 
 		 250 aa  295  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  67.23 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 252 aa  291  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  66.67 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  69.95 
 
 		 279 aa  288  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  62.76 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  62.76 
 
 		 241 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  66.67 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  64.73 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 239 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  65.33 
 
 		 288 aa  278  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 239 aa  278  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  59.83 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  59.41 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  59.09 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  57.74 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  57.74 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 237 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 237 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  57.32 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  57.32 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  57.32 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  58.33 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  57.78 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  54.17 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 238 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 237 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 237 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  57.92 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 238 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  58.12 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  57.98 
 
 		 239 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  60 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  60 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  57.98 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>