More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1364 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  75.2 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  78.54 
 
 		 248 aa  354  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  73.58 
 
 		 252 aa  352  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  78.15 
 
 		 239 aa  349  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  73.11 
 
 		 239 aa  345  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  72.58 
 
 		 254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  71.55 
 
 		 239 aa  342  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  78.24 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  78.24 
 
 		 241 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  72.27 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  75.93 
 
 		 242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  76.44 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  73 
 
 		 247 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  75 
 
 		 238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  77.16 
 
 		 260 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  71.13 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  72.57 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  77.88 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  69.2 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  69.07 
 
 		 251 aa  321  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  68.64 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  72.15 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  74.26 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  69.2 
 
 		 252 aa  311  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  71.19 
 
 		 246 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  67.5 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  67.8 
 
 		 260 aa  309  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  70.69 
 
 		 288 aa  308  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  69.2 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3830  ribonuclease PH  69.92 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3844  ribonuclease PH  69.92 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3918  ribonuclease PH  69.92 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  62.75 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  62.34 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  62.35 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  62.24 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  62.24 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  62.24 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  63.45 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  61.16 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  61 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  62.5 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  60.58 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  60.58 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 239 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  61.76 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  57.61 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  59.5 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  59.5 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  59.5 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  59.5 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  59.5 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  59.5 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  59.09 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 241 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  58.26 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  58.33 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  58.13 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>