More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2581 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  93.6 
 
 		 252 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  79.28 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  74.8 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  76.89 
 
 		 248 aa  360  9e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  73.64 
 
 		 252 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2734  ribonuclease PH  75.32 
 
 		 279 aa  347  7e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0760609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  68.62 
 
 		 239 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  70.29 
 
 		 239 aa  344  8e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  72.15 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  71.37 
 
 		 257 aa  338  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  70.59 
 
 		 238 aa  334  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  73.53 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  68.49 
 
 		 247 aa  332  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  64.88 
 
 		 240 aa  322  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  65 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  66.81 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  69 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  65.5 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3865  ribonuclease PH  68.78 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  65.15 
 
 		 254 aa  304  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1104  ribonuclease PH  64.02 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  68.09 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  62.34 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  63.07 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0994  ribonuclease PH  63.6 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  63.07 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 237 aa  298  8e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  61.51 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1546  ribonuclease PH  65.67 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.760762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  58.75 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0870  ribonuclease PH  66.67 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  67.5 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  58.44 
 
 		 238 aa  293  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 239 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1701  ribonuclease PH  63.87 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.17915  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.25 
 
 		 239 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  59.17 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  60.68 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  59.04 
 
 		 253 aa  289  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  59.41 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  60.25 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 238 aa  289  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  60.83 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  60.92 
 
 		 237 aa  287  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  61.51 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2358  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0822921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  58.4 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  56.1 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29110  ribonuclease PH  64.58 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  59.17 
 
 		 238 aa  285  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  56.1 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 239 aa  284  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.16 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  59 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  59 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  59 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  59 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  57.92 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  56.97 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  55.97 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  55.97 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  58.44 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  55.97 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  59 
 
 		 237 aa  281  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  56.67 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 238 aa  282  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  59.09 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  59.09 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>