More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2326 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  77.06 
 
 
231 aa  367  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  64.91 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  61.47 
 
 
239 aa  299  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  61.04 
 
 
239 aa  297  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  63.2 
 
 
257 aa  297  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  60.78 
 
 
245 aa  295  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  60.78 
 
 
245 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  60.78 
 
 
245 aa  295  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  60.78 
 
 
245 aa  295  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  60.78 
 
 
245 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  60.78 
 
 
245 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  60.34 
 
 
245 aa  294  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  60.34 
 
 
245 aa  294  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  60.34 
 
 
245 aa  293  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  59.83 
 
 
243 aa  290  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  61.3 
 
 
240 aa  290  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  60.17 
 
 
245 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  59.31 
 
 
238 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  58.95 
 
 
238 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  59.65 
 
 
238 aa  288  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  56.96 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  59.21 
 
 
240 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  59.57 
 
 
239 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  58.87 
 
 
238 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  60.61 
 
 
245 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  56.52 
 
 
244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  61.14 
 
 
238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  59.21 
 
 
242 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  59.21 
 
 
242 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  56.77 
 
 
239 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  59.57 
 
 
245 aa  284  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.09 
 
 
238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  59.13 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  58.77 
 
 
243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  60.09 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  58.7 
 
 
237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  57.14 
 
 
239 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  59.31 
 
 
263 aa  281  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  57.58 
 
 
238 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  56.52 
 
 
242 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  57.58 
 
 
238 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  59.05 
 
 
256 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  56.14 
 
 
243 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  58.01 
 
 
258 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  58.77 
 
 
244 aa  279  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  58.52 
 
 
245 aa  279  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  57.89 
 
 
238 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  58.7 
 
 
248 aa  279  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  57.02 
 
 
238 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  57.14 
 
 
243 aa  278  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  55.65 
 
 
238 aa  278  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  53.91 
 
 
253 aa  277  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  59.57 
 
 
261 aa  277  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  61.23 
 
 
246 aa  277  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  58.08 
 
 
258 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  57.14 
 
 
237 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  56.09 
 
 
246 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  56.28 
 
 
238 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  55.84 
 
 
235 aa  275  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  55.84 
 
 
235 aa  275  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  58.26 
 
 
248 aa  275  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  56.96 
 
 
239 aa  275  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  57.14 
 
 
237 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  58.7 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  58.7 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  58.7 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  56.39 
 
 
241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  58.26 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  54.35 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  58.01 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  54.35 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  56.83 
 
 
241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  57.14 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  57.14 
 
 
240 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  56.96 
 
 
239 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  57.14 
 
 
240 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  55.46 
 
 
238 aa  271  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  56.9 
 
 
255 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  56.96 
 
 
239 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  56.96 
 
 
239 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  54.78 
 
 
241 aa  271  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  56.96 
 
 
239 aa  270  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  56.52 
 
 
237 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  53.48 
 
 
246 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  57.39 
 
 
238 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  53.48 
 
 
246 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  53.48 
 
 
246 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  55.02 
 
 
241 aa  269  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  55.02 
 
 
238 aa  269  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  54.39 
 
 
246 aa  269  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  56.96 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  54.39 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  53.48 
 
 
246 aa  268  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  55.84 
 
 
240 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  55.84 
 
 
237 aa  268  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  52.61 
 
 
243 aa  268  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  52.38 
 
 
243 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  52.38 
 
 
243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  52.38 
 
 
243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>