More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3622 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  72.24 
 
 		 245 aa  353  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  62.86 
 
 		 261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  64.61 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  63.01 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  60.16 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  63.67 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  62.96 
 
 		 245 aa  307  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  59.67 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  59.18 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  59.18 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  58.02 
 
 		 248 aa  295  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  59.83 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.8 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  59.24 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  59.83 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  60.08 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  59.24 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  57.39 
 
 		 231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  58.62 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  59.57 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  58.77 
 
 		 232 aa  279  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  59.74 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  55.97 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  58.33 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  57.81 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  57.2 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  59.07 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>