More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1338 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  100 
 
 		 240 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  63.03 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 250 aa  304  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  64.14 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  60.25 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  62.82 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  60.25 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  60.61 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  60.67 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  58.09 
 
 		 255 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 239 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  57.45 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  57.45 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  58.37 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  58.58 
 
 		 248 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  57.92 
 
 		 261 aa  281  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 237 aa  281  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  60.34 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  55.36 
 
 		 246 aa  277  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  57.98 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  56.71 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  56.54 
 
 		 243 aa  271  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  271  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  57.45 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  54.85 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  57.14 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  268  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>