More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1952 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  62.65 
 
 
261 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  63.92 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  65.16 
 
 
250 aa  318  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  61.32 
 
 
245 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  61.66 
 
 
256 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  60.82 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  58.61 
 
 
258 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  299  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  299  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  59.43 
 
 
245 aa  299  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  59.02 
 
 
245 aa  298  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  60.34 
 
 
239 aa  298  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  59.02 
 
 
245 aa  298  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  58.61 
 
 
245 aa  297  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  62.03 
 
 
245 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  60.08 
 
 
244 aa  295  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  57.38 
 
 
248 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  58.9 
 
 
257 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  57.48 
 
 
255 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.6 
 
 
247 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  58.4 
 
 
246 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  61.86 
 
 
238 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  59.75 
 
 
238 aa  290  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  289  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  60.17 
 
 
238 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  60.67 
 
 
240 aa  288  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  61.02 
 
 
239 aa  289  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  55.74 
 
 
248 aa  287  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  62.29 
 
 
239 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  60.26 
 
 
241 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  60.17 
 
 
237 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  60.17 
 
 
243 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  57.81 
 
 
237 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  59.32 
 
 
237 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  59.75 
 
 
237 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  61.54 
 
 
242 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  59.07 
 
 
237 aa  285  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  62.29 
 
 
239 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  62.29 
 
 
239 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  61.54 
 
 
242 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  60.17 
 
 
238 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  60.43 
 
 
243 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  61.44 
 
 
238 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.43 
 
 
239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  61.7 
 
 
239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  59.15 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  59.49 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.43 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  59.75 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  59.75 
 
 
237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  58.4 
 
 
238 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  59.32 
 
 
238 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  60.17 
 
 
238 aa  281  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  58.72 
 
 
246 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  59.15 
 
 
241 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  58.72 
 
 
246 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  60.17 
 
 
239 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  58.9 
 
 
238 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  59.32 
 
 
239 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  59.07 
 
 
238 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  59.49 
 
 
248 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.3 
 
 
239 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  58.47 
 
 
237 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  58.47 
 
 
237 aa  279  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  59.32 
 
 
241 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  58.05 
 
 
237 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  57.21 
 
 
231 aa  278  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  59.75 
 
 
239 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  57.63 
 
 
243 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  61.02 
 
 
238 aa  278  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  60.43 
 
 
237 aa  278  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  58.05 
 
 
243 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  57.2 
 
 
238 aa  278  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  57.63 
 
 
237 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  57.63 
 
 
237 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  57.63 
 
 
237 aa  278  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  57.14 
 
 
238 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  56.36 
 
 
239 aa  277  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  58.47 
 
 
243 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  62.45 
 
 
254 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  57.98 
 
 
238 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  58.08 
 
 
232 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  58.47 
 
 
246 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  58.47 
 
 
246 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  58.47 
 
 
246 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  59.49 
 
 
238 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  60 
 
 
253 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  57.81 
 
 
246 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  60.59 
 
 
238 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>