More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0837 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  69.77 
 
 
263 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  63.37 
 
 
261 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  60.67 
 
 
240 aa  310  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  59.59 
 
 
248 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  59.18 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  58.61 
 
 
258 aa  301  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  59.49 
 
 
240 aa  299  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  60.17 
 
 
257 aa  292  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  55.97 
 
 
245 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  59.05 
 
 
247 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  57.92 
 
 
255 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  52.65 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  54.85 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  57.33 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  55.33 
 
 
261 aa  280  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  58.01 
 
 
232 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  55.04 
 
 
238 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  278  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  278  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  55.51 
 
 
245 aa  278  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  55.51 
 
 
239 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  55.51 
 
 
239 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  56.49 
 
 
245 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  56.07 
 
 
245 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  55.13 
 
 
242 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  55.13 
 
 
242 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  55.97 
 
 
244 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  55.23 
 
 
245 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  56.1 
 
 
256 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  56.78 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  55.08 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  55.46 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  58.01 
 
 
231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  52.52 
 
 
242 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  54.2 
 
 
238 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  56.47 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  53.16 
 
 
238 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  53.39 
 
 
238 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  53.16 
 
 
238 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  55.56 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  54.51 
 
 
243 aa  268  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  52.52 
 
 
238 aa  268  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  53.14 
 
 
243 aa  268  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  55.56 
 
 
239 aa  268  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  54.62 
 
 
245 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  53.39 
 
 
246 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  53.39 
 
 
246 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  53.81 
 
 
238 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  52.3 
 
 
239 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  52.94 
 
 
238 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  53.81 
 
 
248 aa  267  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  55.56 
 
 
239 aa  266  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  54.47 
 
 
246 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  52.97 
 
 
239 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  52.74 
 
 
239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  54.47 
 
 
246 aa  265  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  53.62 
 
 
243 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  53.62 
 
 
244 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  53.33 
 
 
246 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  53.36 
 
 
238 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  53.62 
 
 
244 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  53.81 
 
 
243 aa  265  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  52.12 
 
 
237 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  54.04 
 
 
241 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  53.16 
 
 
239 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  53.16 
 
 
239 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  51.9 
 
 
238 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  52.92 
 
 
246 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  52.32 
 
 
238 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  50.85 
 
 
238 aa  263  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0778  ribonuclease PH  51.9 
 
 
237 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225332  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  52.54 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  52.72 
 
 
247 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  53.39 
 
 
237 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  52.12 
 
 
246 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  54.66 
 
 
237 aa  262  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  52.12 
 
 
246 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  52.12 
 
 
246 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  52.12 
 
 
246 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  51.48 
 
 
239 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  51.06 
 
 
253 aa  261  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  53.19 
 
 
239 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  50.84 
 
 
239 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  54.24 
 
 
237 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  49.79 
 
 
239 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  54.01 
 
 
239 aa  260  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  53.78 
 
 
238 aa  260  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  50.63 
 
 
237 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  51.27 
 
 
243 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  51.27 
 
 
243 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  51.27 
 
 
243 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  51.27 
 
 
243 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  54.24 
 
 
238 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  53.39 
 
 
237 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>