More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0857 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  59.52 
 
 
257 aa  326  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  54.11 
 
 
246 aa  278  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  57.58 
 
 
261 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  55.79 
 
 
238 aa  275  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  57.58 
 
 
231 aa  274  8e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  52.65 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  54.11 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  51.93 
 
 
250 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  56.47 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  53.33 
 
 
242 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  53.33 
 
 
242 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  54.2 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  54.51 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  53.45 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  54.74 
 
 
244 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  53.22 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  56.14 
 
 
245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  53.65 
 
 
255 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  53.78 
 
 
242 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  54.08 
 
 
256 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  52.56 
 
 
243 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  54.85 
 
 
246 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  51.02 
 
 
248 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  51.29 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  54.85 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  53.22 
 
 
238 aa  264  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  54.31 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  53.25 
 
 
244 aa  263  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  54.74 
 
 
247 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  51.28 
 
 
245 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  53.59 
 
 
243 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  52.79 
 
 
238 aa  261  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  50.43 
 
 
239 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  54.74 
 
 
246 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  54.74 
 
 
246 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  57.53 
 
 
246 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  53.25 
 
 
244 aa  260  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  52.74 
 
 
260 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  54.22 
 
 
258 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  52.81 
 
 
239 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  53.22 
 
 
243 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  53.25 
 
 
239 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  51.95 
 
 
246 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  52.36 
 
 
239 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  52.16 
 
 
239 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  53.39 
 
 
243 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  52.56 
 
 
243 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  51.72 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  53.22 
 
 
254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  53.25 
 
 
239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  52.81 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  53.02 
 
 
241 aa  258  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  51.93 
 
 
239 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  51.93 
 
 
239 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  59.33 
 
 
238 aa  258  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  51.07 
 
 
240 aa  257  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  51.5 
 
 
240 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  52.59 
 
 
251 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  52.36 
 
 
238 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  53.65 
 
 
260 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  53.45 
 
 
243 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  51.93 
 
 
238 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  52.79 
 
 
239 aa  255  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  53.45 
 
 
246 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  53.45 
 
 
246 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  53.31 
 
 
252 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  53.45 
 
 
246 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  51.93 
 
 
238 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  52.38 
 
 
232 aa  254  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  53.45 
 
 
246 aa  254  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  52.59 
 
 
239 aa  254  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1020  ribonuclease PH  51.23 
 
 
254 aa  254  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  53.07 
 
 
238 aa  254  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  53.51 
 
 
245 aa  254  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  52.79 
 
 
239 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  53.88 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  53.88 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  53.22 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  54.7 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  52.14 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  51.5 
 
 
240 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  49.15 
 
 
237 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  51.93 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>