More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3361 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  97.07 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  97.07 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  82.7 
 
 		 238 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  297  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 238 aa  294  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  61.86 
 
 		 241 aa  286  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 239 aa  284  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  61.34 
 
 		 238 aa  284  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3641  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  59.32 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  59.57 
 
 		 239 aa  278  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  60 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  59.49 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  59.66 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  60 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  275  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 237 aa  275  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>