More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1100 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  95.82 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  94.98 
 
 		 239 aa  470  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  60.17 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  57.26 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  58.62 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  56.47 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  57.69 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  56.47 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  58.19 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  55.56 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  56.22 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  56.09 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  56.84 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  55.17 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  55.17 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  55.6 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  53.91 
 
 		 231 aa  265  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  55.36 
 
 		 245 aa  264  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  55.36 
 
 		 245 aa  264  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  55.36 
 
 		 245 aa  264  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  54.51 
 
 		 256 aa  264  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  55.36 
 
 		 245 aa  264  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  55.36 
 
 		 245 aa  264  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  55.17 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 261 aa  263  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  55.6 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  56.47 
 
 		 243 aa  262  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  55.13 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  54.74 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  55.13 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  55.17 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 245 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  54.51 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  52.59 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  54.74 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  54.31 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  53.85 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  52.79 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  53.22 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  54.74 
 
 		 239 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  53.42 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  54.7 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  56.33 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  55.9 
 
 		 241 aa  257  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  54.51 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  55.17 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  52.99 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  53.85 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  52.36 
 
 		 253 aa  254  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  53.85 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 246 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 243 aa  254  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  55.13 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  53.25 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  54.27 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  50.42 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.27 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  52.59 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  50 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  51.09 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  54.08 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  50 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  50 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  53.42 
 
 		 239 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  54.98 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.115232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>