More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3937 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  92.44 
 
 		 245 aa  441  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  64.76 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  55.33 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  56.96 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  54.29 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  50.8 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  53.28 
 
 		 258 aa  254  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  53.23 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  59.15 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  58.23 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  55.88 
 
 		 239 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  57.38 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  58.65 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  54.69 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 239 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 243 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  58.08 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 246 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 239 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  51.69 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 239 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  50.22 
 
 		 231 aa  244  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0413  ribonuclease PH  51.74 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  56.09 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  51.64 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  58.3 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3425  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  50.82 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  54.89 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  50.61 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  52.74 
 
 		 239 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  55.74 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  56.6 
 
 		 244 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  54.89 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 237 aa  241  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>