More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0413 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0413  ribonuclease PH  100 
 
 
234 aa  475  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  58.8 
 
 
246 aa  278  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  55.32 
 
 
239 aa  265  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  53.65 
 
 
246 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  53.65 
 
 
246 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  53.65 
 
 
246 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  53.22 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  52.79 
 
 
246 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  52.79 
 
 
246 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  52.16 
 
 
243 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  52.81 
 
 
246 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  53.42 
 
 
238 aa  255  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  51.72 
 
 
243 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  52.16 
 
 
246 aa  254  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  52.79 
 
 
245 aa  254  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  54.51 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  52.14 
 
 
246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  51.5 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  53.22 
 
 
246 aa  251  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  54.27 
 
 
247 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  54.31 
 
 
239 aa  250  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  54.87 
 
 
231 aa  249  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  51.52 
 
 
246 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  51.29 
 
 
238 aa  247  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  51.29 
 
 
243 aa  247  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  52.16 
 
 
242 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  52.14 
 
 
245 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  49.36 
 
 
238 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  52.54 
 
 
258 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  52.84 
 
 
244 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  52.16 
 
 
238 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  53.25 
 
 
248 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  52.59 
 
 
238 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  52.56 
 
 
245 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  51.71 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  50.65 
 
 
239 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  50.86 
 
 
238 aa  244  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  50.86 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  51.93 
 
 
245 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  51.74 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  54.42 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  53.25 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  53.57 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  54.98 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  53.45 
 
 
243 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  51.5 
 
 
237 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  52.99 
 
 
248 aa  241  9e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  51.29 
 
 
239 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  52.59 
 
 
238 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  50.87 
 
 
245 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  51.07 
 
 
238 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  52.79 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  51.28 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  53.22 
 
 
237 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  49.78 
 
 
242 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  51.07 
 
 
240 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  50 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  50 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  51.07 
 
 
240 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  50.86 
 
 
239 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1751  ribonuclease PH  48.9 
 
 
238 aa  236  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  51.72 
 
 
239 aa  236  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  50.64 
 
 
245 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  51.72 
 
 
238 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  50.86 
 
 
241 aa  235  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  50.64 
 
 
240 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  50 
 
 
239 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  50 
 
 
238 aa  235  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  51.52 
 
 
246 aa  235  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  50.64 
 
 
240 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  50.43 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  53.25 
 
 
238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  50.21 
 
 
241 aa  234  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  49.14 
 
 
239 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  49.14 
 
 
237 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  50.21 
 
 
239 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  51.29 
 
 
240 aa  234  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  50.21 
 
 
240 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  51.29 
 
 
241 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  51.5 
 
 
237 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  51.72 
 
 
239 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  51.93 
 
 
237 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  51.93 
 
 
237 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  51.72 
 
 
239 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  51.93 
 
 
237 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  50.21 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  50.22 
 
 
250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>