More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1073 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  67.93 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  63.95 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  64.56 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0270  ribonuclease PH  58.8 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2074  ribonuclease PH  58.37 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24551  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  52.54 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  57.45 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  54.89 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  52.19 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  57.27 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  54.47 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  55.32 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  52.54 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  55.32 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  56.17 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  54.89 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  56.17 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  53.14 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  52.12 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  54.47 
 
 		 235 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  54.47 
 
 		 235 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 260 aa  248  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 238 aa  248  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 244 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 244 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  54.11 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  52.34 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  52.54 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  53.22 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  52.59 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 237 aa  244  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 260 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  50.63 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  52.92 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  51.69 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  52.12 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  55.31 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>