More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2074 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2074  ribonuclease PH  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0270  ribonuclease PH  80.66 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24551  ribonuclease PH  73.66 
 
 		 244 aa  360  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  58.37 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  57.87 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  53.72 
 
 		 246 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  56.65 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1751  ribonuclease PH  57.58 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  55.23 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  56.77 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  53.25 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  48.09 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  53.68 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  52.77 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  54.55 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  50.42 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  54.47 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  54.47 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  52.89 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  52.89 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  53.31 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  47.9 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  54.04 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  54.51 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  50.65 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  48.51 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  51.06 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  52.89 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  51.68 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  52.89 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  53.78 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  46.64 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  55.65 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  52.34 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  52.44 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  48.51 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  51.49 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  46.72 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  52.77 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  51.68 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  50.41 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  51.49 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>