More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0165 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09120  RNAse PH  64.35 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.255982  normal  0.080904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  60.52 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  57.56 
 
 		 238 aa  271  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  58.37 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  56.65 
 
 		 244 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  56.22 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  55.56 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  53.04 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  59.23 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  55.79 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  59.83 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  56.3 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  53.47 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  55.37 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  56.84 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0401  ribonuclease PH  56.84 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  53.45 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  54.81 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  55.79 
 
 		 238 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 238 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  58.37 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0434  ribonuclease PH  56.84 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  55.79 
 
 		 243 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  55.98 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  54.08 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  53.48 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  55.79 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  56.65 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  55.84 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  55.84 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  52.87 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 238 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  55.56 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  53.28 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  54.7 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  55.93 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  55.32 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  52.56 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  53.22 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  54.81 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  54.89 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  54.94 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  52.14 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  53.42 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  53.22 
 
 		 239 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  55.41 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0778  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225332  normal  0.269396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>