More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24551 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24551  ribonuclease PH  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2074  ribonuclease PH  73.66 
 
 		 243 aa  360  9e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0270  ribonuclease PH  72.43 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  56.17 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  52.36 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  55.36 
 
 		 246 aa  250  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  53.72 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  53.72 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  51.68 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  52.3 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1751  ribonuclease PH  57.27 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  52.94 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  51.28 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  54.04 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  52.77 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  51.49 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  54.98 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  51.06 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  51.04 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  51.27 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  50 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  49.18 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  51.68 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  50.42 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  51.3 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  51.69 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  51.72 
 
 		 241 aa  231  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  52.12 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  52.12 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  51.93 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  50.61 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 243 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  47.9 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  48.95 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  47.06 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  48.09 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  51.49 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  49.57 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  47.95 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  47.68 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  50.84 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  48.51 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  51.07 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  50 
 
 		 245 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  50.2 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  50.42 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  49.38 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  51.06 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>