More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0270 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0270  ribonuclease PH  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2074  ribonuclease PH  80.66 
 
 		 243 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24551  ribonuclease PH  72.43 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  58.8 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  56.17 
 
 		 238 aa  271  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  56.67 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  54.96 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 247 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  55.84 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1751  ribonuclease PH  56.28 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 239 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 245 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  49.58 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  53.25 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  51.26 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  53.31 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  53.31 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  52.92 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  54.04 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  53.31 
 
 		 244 aa  244  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  52.38 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 239 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  53.02 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  52.34 
 
 		 246 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  48.09 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  52.16 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  49.79 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  49.37 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  51.93 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  52.34 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  51.06 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  54.67 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  50.85 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  53.09 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  51.68 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  50.64 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  53.33 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  53.33 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  51.29 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  53.62 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  51.03 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  55.26 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 239 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  53.19 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  50.42 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  52.34 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  51.72 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  50.42 
 
 		 238 aa  238  9e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  52.59 
 
 		 238 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  48.54 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  51.29 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  52.16 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  51.49 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  53.5 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  52.3 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>