More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3656 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  62.75 
 
 
261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  65.13 
 
 
245 aa  301  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  57.32 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  54.2 
 
 
244 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  53.59 
 
 
246 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  57.63 
 
 
241 aa  263  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  55.93 
 
 
247 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  56.78 
 
 
239 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  57.56 
 
 
240 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0167  ribonuclease PH  54.66 
 
 
242 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  56.72 
 
 
238 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  52.94 
 
 
248 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  59.83 
 
 
250 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  56.36 
 
 
241 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  54.17 
 
 
250 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  53.33 
 
 
245 aa  255  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  53.91 
 
 
245 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  56.54 
 
 
246 aa  255  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  58.72 
 
 
241 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  55.08 
 
 
243 aa  254  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  57.63 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  56.36 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  54.2 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  52.92 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  55.04 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  51.68 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1505  ribonuclease PH  54.17 
 
 
261 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  52.74 
 
 
258 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  52.67 
 
 
245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  54.39 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  52.74 
 
 
238 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  52.74 
 
 
238 aa  251  6e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  55.88 
 
 
239 aa  251  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  50.22 
 
 
232 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  53.39 
 
 
238 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  55.04 
 
 
238 aa  250  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  51.87 
 
 
261 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  55.92 
 
 
247 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  56.3 
 
 
239 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  52.36 
 
 
239 aa  249  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  53.16 
 
 
238 aa  250  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  55.46 
 
 
256 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  54.85 
 
 
239 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  53.59 
 
 
238 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  55.08 
 
 
238 aa  248  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  52.08 
 
 
245 aa  248  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  54.24 
 
 
238 aa  248  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  55.23 
 
 
243 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  56.33 
 
 
254 aa  248  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  49.13 
 
 
231 aa  248  9e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  52.36 
 
 
239 aa  247  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  55.27 
 
 
243 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  54.43 
 
 
237 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  53.45 
 
 
237 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  56.54 
 
 
244 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  54.85 
 
 
238 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  52.32 
 
 
239 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  56.83 
 
 
245 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  51.06 
 
 
241 aa  245  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  56.12 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3006  ribonuclease PH  55.08 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  53.54 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  54.04 
 
 
246 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  52.32 
 
 
239 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  54.01 
 
 
238 aa  244  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  52.74 
 
 
237 aa  244  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  53.53 
 
 
260 aa  244  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  53.59 
 
 
246 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  54.2 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  54.51 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  52.74 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  53.45 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  51.9 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  55.74 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  50.63 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.2 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  47.7 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  51.25 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  52.26 
 
 
245 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  56.03 
 
 
241 aa  242  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  53.59 
 
 
237 aa  242  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0773  ribonuclease PH  53.47 
 
 
245 aa  242  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  52.54 
 
 
239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  57.87 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  53.19 
 
 
238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  53.59 
 
 
237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  52.52 
 
 
242 aa  241  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  51.68 
 
 
239 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  55.51 
 
 
238 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  54.51 
 
 
242 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  53.42 
 
 
239 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>