More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0395 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  67.81 
 
 
260 aa  318  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  54.36 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  56.02 
 
 
239 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  56.02 
 
 
239 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  56.49 
 
 
238 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  53.97 
 
 
238 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  52.24 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  54.36 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  54.36 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  53.94 
 
 
239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  53.97 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  51.87 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  54.36 
 
 
239 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  53.72 
 
 
240 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  51.45 
 
 
245 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  54.13 
 
 
240 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  53.81 
 
 
247 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  54.13 
 
 
240 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  54.55 
 
 
240 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  53.72 
 
 
240 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  54.55 
 
 
240 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  50.84 
 
 
239 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  50.84 
 
 
241 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  53.31 
 
 
240 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  50.84 
 
 
239 aa  247  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  51.72 
 
 
231 aa  247  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  52.32 
 
 
238 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  51.88 
 
 
240 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  52.32 
 
 
238 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  55.65 
 
 
238 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  52.59 
 
 
232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  56.12 
 
 
238 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  56.12 
 
 
238 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  56.12 
 
 
238 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  53.56 
 
 
238 aa  245  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  52.5 
 
 
238 aa  244  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  54.27 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  51.9 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  48.65 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  54.85 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  51.87 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  55.65 
 
 
238 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  52.72 
 
 
238 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  50.2 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  51.28 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  50.99 
 
 
251 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  54.51 
 
 
244 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  47.88 
 
 
248 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  54.43 
 
 
238 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  54.43 
 
 
238 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  54.43 
 
 
238 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  54.43 
 
 
238 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  54.43 
 
 
238 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  52.72 
 
 
240 aa  241  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  52.94 
 
 
244 aa  241  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  51.45 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  50.84 
 
 
237 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  52.38 
 
 
250 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  51.04 
 
 
250 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.97 
 
 
243 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  52.94 
 
 
244 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  48.75 
 
 
239 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  54.43 
 
 
238 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  54.81 
 
 
238 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  52.7 
 
 
256 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  53.48 
 
 
245 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  50.62 
 
 
245 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  54.39 
 
 
238 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  52.4 
 
 
260 aa  238  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  51.68 
 
 
238 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  51.69 
 
 
253 aa  238  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  51.88 
 
 
238 aa  238  8e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  50.21 
 
 
238 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  52.72 
 
 
238 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  49.58 
 
 
237 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  50.21 
 
 
245 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  51.25 
 
 
243 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  48.09 
 
 
260 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  48.96 
 
 
263 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  49.79 
 
 
237 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  50.62 
 
 
245 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  49.17 
 
 
258 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  50.84 
 
 
239 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  52.8 
 
 
247 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  50.84 
 
 
237 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  51.45 
 
 
241 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>