More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4210 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  67.81 
 
 		 270 aa  318  6e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  57.02 
 
 		 247 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  55.33 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  56.72 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  57.08 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  53.28 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  56.07 
 
 		 238 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  57.94 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  51.87 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  56.65 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  54.62 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  51.46 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  52.74 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  51.88 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  51.67 
 
 		 243 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  51.88 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  51.29 
 
 		 231 aa  247  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  51.93 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  51.65 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  50.63 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  53.16 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  54.51 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.36 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  53.56 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  51.5 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  50.21 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  51.24 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  52.3 
 
 		 243 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  53.33 
 
 		 239 aa  242  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  51.04 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  53.97 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  53.11 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  50.83 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 239 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  51.45 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  51.93 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  51.93 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  51.91 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  52.72 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  51.04 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  54.15 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  55.27 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  49.37 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  54.36 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>