More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0773 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0773  ribonuclease PH  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  58.9 
 
 
239 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  54.29 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  54.66 
 
 
239 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  55.04 
 
 
238 aa  252  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  55.17 
 
 
247 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  54.01 
 
 
243 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  54.39 
 
 
238 aa  249  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  54.85 
 
 
241 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  53.94 
 
 
246 aa  248  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  53.75 
 
 
238 aa  248  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  53.14 
 
 
238 aa  248  8e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  53.39 
 
 
238 aa  248  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  52.28 
 
 
263 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  52.17 
 
 
231 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  51.9 
 
 
239 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  54.66 
 
 
246 aa  245  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  55.46 
 
 
240 aa  244  8e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  50.84 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  51.44 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  53.59 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  52.1 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  55.08 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  55.74 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  55.74 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  53.33 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  53.33 
 
 
244 aa  241  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  51.85 
 
 
243 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  51.03 
 
 
245 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  51.65 
 
 
255 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  50.83 
 
 
245 aa  241  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  52.52 
 
 
252 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  51.9 
 
 
243 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  53.36 
 
 
261 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  53.39 
 
 
246 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  52.03 
 
 
246 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  52.07 
 
 
246 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  52.03 
 
 
246 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  55.08 
 
 
238 aa  239  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  52.03 
 
 
246 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  54.2 
 
 
241 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  52.92 
 
 
242 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  55.27 
 
 
237 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  52.02 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  54.55 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  51.67 
 
 
240 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  54.24 
 
 
239 aa  238  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  53.28 
 
 
238 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  52.99 
 
 
235 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  52.99 
 
 
235 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  53.36 
 
 
262 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  50.21 
 
 
246 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  51.65 
 
 
247 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  50.21 
 
 
246 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  52.92 
 
 
252 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3035  ribonuclease PH  53.59 
 
 
242 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  51.64 
 
 
246 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  54.81 
 
 
243 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  51.26 
 
 
248 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.32 
 
 
243 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  52.72 
 
 
261 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  55.22 
 
 
250 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  55.08 
 
 
239 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  51.3 
 
 
232 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  49.79 
 
 
245 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  55.51 
 
 
245 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2671  ribonuclease PH  52.72 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  52.32 
 
 
241 aa  235  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  53.81 
 
 
239 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  51.69 
 
 
238 aa  234  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  52.52 
 
 
239 aa  234  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  52.32 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  52.32 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  53.72 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  51.64 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  53.81 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  52.1 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  52.72 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  53.72 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  53.72 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  51.46 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  51.9 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  52.77 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2001  ribonuclease PH  52.1 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0484404 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  52.74 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  51.49 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  53.78 
 
 
248 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  54.59 
 
 
250 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  52.08 
 
 
250 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  50.83 
 
 
246 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  53.56 
 
 
238 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  51.07 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  56.28 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>