191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0168 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.67 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  44.8 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.85 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  47.37 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  46.64 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.67 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  44.79 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  43.27 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  35.74 
 
 		 257 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.84 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  42.21 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  37.6 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  32.68 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  28.45 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  28.39 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  30.08 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  25.88 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  26.01 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  25.64 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  27.15 
 
 		 764 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1106  ribonuclease PH  29.49 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1177  ribonuclease PH  27.27 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.217753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  30.25 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  28.93 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  25.79 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01680  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  22.93 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.604271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  30.61 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  23.93 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  29.55 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  26.27 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  26.27 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  29.71 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  26.36 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0434  ribonuclease PH  27.35 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0401  ribonuclease PH  26.91 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  26.91 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  28.19 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  28.29 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  30.06 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  29.93 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  29.93 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  28.29 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  29.93 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  26.14 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  26.94 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  29.53 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  31.29 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  28.86 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  26.14 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  27.7 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  25 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  27.7 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  29.7 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  29.73 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  28.69 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  30.61 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  25.63 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  25 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  30.61 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  26.86 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  29.05 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  24.42 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  29.93 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  25.21 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  25.4 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  25.74 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  29.93 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.82 
 
 		 701 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  30.14 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  29.25 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  26.97 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  27.06 
 
 		 245 aa  48.9  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  26.32 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  29.73 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  25.29 
 
 		 732 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  28.67 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1866  ribonuclease PH  28.93 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0439294  normal  0.0144701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  27.98 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  26.97 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  29.25 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>