More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0181 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  51.76 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  52.61 
 
 		 259 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  49.01 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  47.86 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.69 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  44.79 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  47.08 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  41.95 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.78 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.27 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.03 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  40.15 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  32.17 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  28.05 
 
 		 307 aa  108  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  29.51 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  35.59 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  28.26 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  31.3 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  28.02 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  26.41 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  26.67 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  28.7 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  25.98 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  25.86 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  28.39 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  26.41 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  27.9 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  29.13 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  26.52 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  27.42 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  28.38 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  30.49 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  27.39 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  28.38 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  30.04 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  30.04 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  26.2 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  26.87 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  29.55 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  29.52 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5650  ribonuclease PH  35.81 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  27.51 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  29 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  28.15 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  34.23 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  26.52 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  26.29 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  28.51 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  29.58 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  37.5 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  29.52 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  29.74 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  30.1 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  30.1 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  25.93 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  30.1 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  29.05 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1364  ribonuclease PH  36.73 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  30.17 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  25.86 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  28.88 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  28.88 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  28.44 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  28.88 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  29.83 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  28 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  26.09 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  26.09 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  26.84 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  28.88 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  28.85 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  27.97 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  26.5 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  28.85 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  28.85 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  27.17 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  27.16 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>