More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0167 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  59.75 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  57.5 
 
 		 246 aa  291  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  60.17 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  53.56 
 
 		 245 aa  274  7e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  51.05 
 
 		 245 aa  271  9e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  59.75 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  51.85 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  51.67 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  47.58 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  49.14 
 
 		 343 aa  228  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  47.81 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  45.69 
 
 		 501 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  39.81 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.27 
 
 		 699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  33.89 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.33 
 
 		 740 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.35 
 
 		 752 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.62 
 
 		 747 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000737281  hitchhiker  0.00038852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.01 
 
 		 736 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.62 
 
 		 693 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.66 
 
 		 732 aa  105  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.05 
 
 		 772 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3180  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.62 
 
 		 746 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.846647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.67 
 
 		 708 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.67 
 
 		 708 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  31.12 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.83 
 
 		 703 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  37.17 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 		 700 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35 
 
 		 701 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.99 
 
 		 693 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  31.2 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  34.18 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  32.94 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  35.45 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  35.18 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  28.03 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  32.98 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.63 
 
 		 700 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  28.39 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  35.29 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 705 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  27.92 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  29.8 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  32.8 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  34.04 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  34.04 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  32.83 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.86 
 
 		 695 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  34.04 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  34.04 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.98 
 
 		 732 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  32.07 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1390  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.63 
 
 		 719 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  30.12 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0599  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.03 
 
 		 736 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.69 
 
 		 690 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1269  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.63 
 
 		 719 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.93 
 
 		 692 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  32.98 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 		 718 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.49 
 
 		 712 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  34.43 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1822  3' exoribonuclease  32.02 
 
 		 714 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000787127  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.78 
 
 		 697 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  34.55 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  28.75 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.18 
 
 		 735 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  32.98 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1979  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.33 
 
 		 710 aa  95.1  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000019638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  31 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  32.46 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  35.29 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2817  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.52 
 
 		 757 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0506  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.45 
 
 		 734 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  31 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  33.67 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  31.55 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  27.39 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  33.17 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  31.55 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  31.55 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  35.29 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.62 
 
 		 699 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  33.51 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  33.16 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0143  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.02 
 
 		 703 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>