35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30583 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  100 
 
 		 285 aa  559  1e-158  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.88 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.01 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  30.16 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  31.67 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.89 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.21 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  30.2 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.1 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.79 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  25.62 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  27.42 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  24.33 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  23.53 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  31.89 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  31.63 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26622  predicted protein  36.84 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.604271 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  30.92 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  28.95 
 
 		 764 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  30.34 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  26.67 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  28.34 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  29.21 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  30.26 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  24.51 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  27.72 
 
 		 711 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1292  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.78 
 
 		 721 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13921  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.7 
 
 		 721 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.9 
 
 		 722 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16651  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.9 
 
 		 722 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409727  normal  0.910712 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.59 
 
 		 721 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13631  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  26.01 
 
 		 721 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  26.42 
 
 		 752 aa  43.9  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6517  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  27.67 
 
 		 793 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433198  normal  0.175574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>