81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48173 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  100 
 
 		 764 aa  1570    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  30.4 
 
 		 293 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  38 
 
 		 347 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  30.11 
 
 		 292 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  30.37 
 
 		 288 aa  140  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  31.3 
 
 		 291 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  30.68 
 
 		 290 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  29.83 
 
 		 296 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  31.83 
 
 		 299 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  32.77 
 
 		 296 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  36.97 
 
 		 301 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  34.28 
 
 		 299 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  26.88 
 
 		 297 aa  108  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  29.81 
 
 		 301 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  30.09 
 
 		 291 aa  103  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  27.71 
 
 		 294 aa  103  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  27.14 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  31.5 
 
 		 299 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  26.77 
 
 		 287 aa  94.7  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  29.13 
 
 		 301 aa  94.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.52 
 
 		 276 aa  91.7  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  26.88 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  30.07 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.76 
 
 		 257 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  31.08 
 
 		 280 aa  76.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  31.98 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  27.12 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  27.15 
 
 		 279 aa  70.1  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  31.11 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  28.51 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.46 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  29.89 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1121  ROK  29.11 
 
 		 330 aa  63.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.81 
 
 		 272 aa  59.7  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0982  ROK family protein  27 
 
 		 308 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  27.8 
 
 		 297 aa  54.7  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  29.36 
 
 		 285 aa  54.3  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.32 
 
 		 323 aa  53.5  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  29.3 
 
 		 335 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  28.81 
 
 		 321 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  28.04 
 
 		 323 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  26.35 
 
 		 321 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  25.19 
 
 		 270 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  26.38 
 
 		 281 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  25 
 
 		 292 aa  49.3  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  47.83 
 
 		 246 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  22.48 
 
 		 315 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  22.48 
 
 		 315 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  29.8 
 
 		 315 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  47.8  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  48.98 
 
 		 288 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  23.11 
 
 		 316 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.24 
 
 		 699 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  47.73 
 
 		 246 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  44.64 
 
 		 252 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25.52 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  31.65 
 
 		 140 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  26.04 
 
 		 260 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  27.54 
 
 		 421 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  22.11 
 
 		 321 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  21.25 
 
 		 307 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  30.26 
 
 		 302 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  23.82 
 
 		 319 aa  45.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01680  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 		 332 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  47.73 
 
 		 245 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  48.94 
 
 		 239 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  23.42 
 
 		 302 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  27.49 
 
 		 312 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  28.19 
 
 		 318 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  22.44 
 
 		 297 aa  45.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  23.37 
 
 		 295 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1048  ROK family protein  32.09 
 
 		 361 aa  44.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  49.02 
 
 		 242 aa  44.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  23.89 
 
 		 295 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  25.17 
 
 		 245 aa  44.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  21.46 
 
 		 381 aa  44.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  25.67 
 
 		 393 aa  44.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.23 
 
 		 398 aa  44.3  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  26.04 
 
 		 299 aa  44.3  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  48.94 
 
 		 239 aa  44.3  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  25.59 
 
 		 310 aa  44.3  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>