268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3962 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  100 
 
 		 296 aa  610  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  39.45 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  38.7 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  38.75 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  37.04 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  36.77 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  37.46 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  37.75 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  39.06 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  38.18 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  36.9 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  33.67 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  36.58 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  36.33 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  32.2 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  32.66 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  35.49 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  40.3 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  36.18 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  33.22 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  30.56 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  31.64 
 
 		 764 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  30.47 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.02 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.02 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  28.05 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  28.24 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  26.49 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  28 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  27.1 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  31.28 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.1 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  27.67 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  27.47 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  27.47 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  27.47 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.83 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  27.17 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  25.85 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  25.44 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  28.32 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  31.8 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  24.9 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  27.44 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  29.17 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  23.49 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.82 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  23.69 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  27.78 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  34.19 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  26.1 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.27 
 
 		 398 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  27.22 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  26.42 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.81 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  29.85 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  23.49 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.85 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  24.84 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.79 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  24.59 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.2 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  26.54 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  27.04 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  28.5 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.35 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.5 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  24.9 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  26.04 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03956  D-allose kinase  26.83 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.689878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3907  ROK familiy protein  26.83 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  25.81 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03916  hypothetical protein  26.83 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.61 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  29.11 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  27.94 
 
 		 363 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  30.63 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  27.04 
 
 		 385 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  31.97 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  29.35 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  26.18 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  34.58 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.02 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  25 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  26.13 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.52 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.64 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  25.4 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.52 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  23.71 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  25.63 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  23.47 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  24.58 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4550  D-allose kinase  27.64 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  36.36 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  27.24 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  24.53 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  25.47 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  31.15 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  30.41 
 
 		 361 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>