More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1578 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  57.86 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  55.27 
 
 		 290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  52.3 
 
 		 293 aa  339  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  46.32 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  46.88 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  47.92 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  47.22 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  43.25 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  43.36 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  47.69 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  43.9 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  44.91 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  44.22 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  38.57 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  38.28 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  41.55 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  38.91 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  38.7 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  32.87 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  32.87 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.1 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.1 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  30.68 
 
 		 764 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.75 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  27.07 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.54 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  26.96 
 
 		 315 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.06 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  26.56 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  28.84 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  26.96 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.6 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.46 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  26.3 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  29.61 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  27.78 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.8 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  27.19 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  26.8 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  26.76 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  23.99 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  29.5 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  28.41 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  25.7 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.97 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.97 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  27.59 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  27.59 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.52 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  27.97 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  26.09 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  24.9 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  28.66 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.97 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  26.89 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  27 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.45 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  25.25 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.77 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.89 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  24.45 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.64 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  29.65 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  25.31 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  25.9 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  27.59 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.78 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  26.64 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  23.68 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  26.4 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  25.31 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  26.23 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  28.38 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  26.06 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.76 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  27.71 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  24.82 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  25.16 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  28.91 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.51 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.37 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  26.65 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.05 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.72 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  34.03 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  25 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.57 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  27.54 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.01 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  30.36 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  30.05 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  24.9 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.53 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.19 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  25.59 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  26.95 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26.95 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26.95 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  25.46 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>