More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0014 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  100 
 
 		 294 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  47.96 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  48.8 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  50 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  47.04 
 
 		 291 aa  238  6.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  40.62 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  41.81 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  40.29 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  41.69 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  38.98 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  38.57 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  38.41 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  39.06 
 
 		 296 aa  191  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  39.21 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  38.64 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  36.42 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  29.97 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  33 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  33.55 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  32.13 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  29.94 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.92 
 
 		 322 aa  89  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  28.57 
 
 		 764 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.92 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.98 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.98 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.6 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  25.38 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  24.75 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  27.08 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  31.05 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  25.3 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.15 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  29.1 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  25.29 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  24.72 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  29.53 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  27.44 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.88 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  25.96 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  25.97 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  31.16 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  29.63 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  27.05 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  25.34 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  23.9 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  28.49 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  27.57 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  26.67 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  25.55 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  25.54 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  27.09 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  25.51 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  29.95 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  23.51 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  26.51 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  29.95 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  27.11 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  25.61 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  26.46 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  25.86 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  26.46 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  26.46 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  25.96 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  27.37 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  26.94 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.72 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  33.12 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  25.67 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.11 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  28.92 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  25.61 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  32.43 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  22.49 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.91 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  28.4 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.79 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  25.97 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  29.08 
 
 		 361 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.53 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  31.11 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  25.98 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  25.55 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  23.9 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  23.24 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.33 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  23.92 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.14 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  23.79 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  30.57 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  25.63 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.5 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  25.55 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  24.44 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  27.75 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  26.33 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  23.64 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  23.81 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.33 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>