279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0932 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0932  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  100 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1938  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  81.68 
 
 		 276 aa  467  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0835  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  79.12 
 
 		 274 aa  436  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1380  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  81.11 
 
 		 273 aa  432  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0168  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  45.67 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00118576  normal  0.188024 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0078  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  43.64 
 
 		 280 aa  204  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.175337  hitchhiker  0.00423326 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0580  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  43.12 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1361  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.69 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.918762  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1791  3' exoribonuclease  38.55 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0181  3' exoribonuclease  40.15 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0578869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2507  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  38.11 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.142847  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0200  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  37.22 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0433  exosome complex RNA-binding protein Rrp42  39.76 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00701931 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02010  exosome complex exonuclease rrp45, putative  32.16 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08280  Opa-interacting protein OIP2, putative  35.92 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06111  exosome complex endonuclease 2/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08860)  27.91 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000732301  normal  0.0523643 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59559  predicted protein  26.92 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  29.76 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  29.89 
 
 		 764 aa  79  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30583  predicted protein  30.84 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0123665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  31.92 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  29.73 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5981  predicted protein  28.33 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562126  normal  0.193352 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  28.97 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  29.34 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  26.07 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  29.57 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  27.53 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  29.41 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0857  ribonuclease PH  26.92 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0105956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  26.44 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  27.53 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5092  ribonuclease PH  27.91 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000962489  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  25 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  28.74 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  24.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  26.25 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3763  ribonuclease PH  30.42 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0942  ribonuclease PH  29.51 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485263  normal  0.641045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  28.63 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  28.81 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  29.05 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  25.69 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  28.4 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7553  ribonuclease PH  30.73 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  29.8 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  26.67 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  27.12 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1289  ribonuclease PH  27.14 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  25.94 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  25.94 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  24.17 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  28.22 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0339  tRNA nucleotidyltransferase  27.84 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1072  ribonuclease PH  27.14 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0967941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  25.77 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1073  ribonuclease PH  25.69 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.213098  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  25.31 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  27.8 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  26.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20050  RNAse PH  27.76 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  24.11 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  29.05 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0567  ribonuclease PH  28.93 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  24.11 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  27.92 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2658  ribonuclease PH  27.03 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.624871  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  27.39 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1525  ribonuclease PH  25.79 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.037998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  25.98 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16560  predicted protein  27.31 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1100  ribonuclease PH  27.14 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  27.39 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  28.16 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  27.39 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  27.03 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  26.56 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0413  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  26.32 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  27.56 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  27.03 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  27.56 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  27.27 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  29.02 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  27.39 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  28.51 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1326  ribonuclease PH  29.71 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.777119  hitchhiker  0.000286825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  27.31 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  26.72 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  30.61 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  25.37 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  28.57 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  36.63 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  27.91 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  25.56 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>