More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1792 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  74.59 
 
 
245 aa  396  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  58.82 
 
 
246 aa  301  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  60.08 
 
 
246 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  61.34 
 
 
246 aa  295  6e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  56.77 
 
 
244 aa  286  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  57.45 
 
 
245 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  57.2 
 
 
245 aa  281  9e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  53.56 
 
 
242 aa  274  8e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  61.34 
 
 
246 aa  274  9e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  54.89 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  52.61 
 
 
501 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  49.57 
 
 
343 aa  244  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  32.8 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  32.92 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  32.37 
 
 
240 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  32.37 
 
 
240 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  32.37 
 
 
240 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  32.37 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  31.54 
 
 
240 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  31.36 
 
 
241 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  31.95 
 
 
240 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1612  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.63 
 
 
699 aa  108  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.322426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  31.54 
 
 
240 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  30.83 
 
 
239 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.76 
 
 
693 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  30.42 
 
 
239 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0790  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.45 
 
 
703 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.41 
 
 
708 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1438  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.41 
 
 
708 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.92 
 
 
752 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  30.54 
 
 
258 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.47 
 
 
705 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  30 
 
 
239 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  31.38 
 
 
238 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.44 
 
 
701 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0835  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.18 
 
 
722 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  32.07 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  28.99 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0569  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.18 
 
 
695 aa  99.4  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  29.96 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 
732 aa  98.6  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.47 
 
 
733 aa  98.2  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1167  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.9 
 
 
698 aa  97.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.51 
 
 
772 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  31.33 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  31.51 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  33.67 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1822  3' exoribonuclease  31.71 
 
 
714 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000787127  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0506  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.4 
 
 
734 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  29.88 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.43 
 
 
740 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0230  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.08 
 
 
693 aa  96.3  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.336814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  29.63 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.08 
 
 
732 aa  96.3  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  29.88 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  34.18 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  31.22 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  30.25 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  30.9 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3937  ribonuclease PH  30.34 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.510656  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  30.47 
 
 
237 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  30.67 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  28.23 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  28.23 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1269  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.05 
 
 
719 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124632  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1390  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.05 
 
 
719 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0472  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.35 
 
 
718 aa  95.1  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  32.77 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  27.8 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  31.98 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92599  predicted protein  31.17 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798783  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1062  ribonuclease PH  31.54 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31 
 
 
713 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  33.47 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0338  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.89 
 
 
796 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0332916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3232  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.98 
 
 
761 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.555601 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.11 
 
 
796 aa  94  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  29.17 
 
 
239 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  33.05 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  30.17 
 
 
238 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0143  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.37 
 
 
703 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1146  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.98 
 
 
693 aa  93.2  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  31.12 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  30.9 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  28.87 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  32.19 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10960  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  31.71 
 
 
743 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000522629  unclonable  0.00000000397306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  29.17 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  29.71 
 
 
250 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  29.29 
 
 
238 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2089  ribonuclease PH  31.06 
 
 
238 aa  92  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.102382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.13 
 
 
815 aa  92  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  31.22 
 
 
240 aa  92  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.3 
 
 
697 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  28.86 
 
 
260 aa  91.7  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1656  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.81 
 
 
736 aa  91.7  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.32 
 
 
755 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1734  tRNA nucleotidyltransferase  30.54 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.636855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>